论文格式本身不会直接影响核心论文查重结果，但格式不正确可能导致间接问题影响最终报告上的重复率数值。具体可以这样理解：

查重引擎抓的是文字，不是排版： 主流查重系统的算法核心是分析论文提交的文本内容。它们会解析你上传文件里的文字序列，忽略或专门处理掉大部分排版信息（如字体大小、颜色、页边距、特殊符号、图像等）。它们关心的是“你写了什么词句”，而不是“这些词句排成什么样”。

关键：格式影响“识别范围”和“识别精度”

结构识别（目录、参考文献等）： 正确应用Word的“样式”功能生成目录、设置规范的标题级别，通常帮助查重系统更准确地识别哪部分是目录、哪部分是正文、哪部分是参考文献列表。系统会对识别的部分（特别是参考文献、标准格式的封面、目录等）排除计算或不参与正文重复率计算。如果格式混乱：

目录混乱： 纯手工打出来的“目录”或格式错乱，可能被系统当作正文文本处理，里面包含的标题文字会被拿去比对，可能导致这部分的重复（因为标题很可能与他人论文标题重复）。

参考文献错误： 这是最常见的问题。规范的参考文献列表有特定的格式（悬挂缩进、作者标题期刊信息清晰）。系统通过格式和位置来判断哪些是参考文献。如果格式乱、没有编号、或排版与正文混杂不清，查重系统可能无法准确识别这些是引用的文献条目，而是将它们当成正文内容参与比对。 这就很冤枉了——文献条目（尤其是标题、作者、期刊名）本身必然是重复的，会显著拉高重复率。

脚注/尾注处理： 对于加了脚注或尾注的引文或注释，查重系统会将其内容排除在正文查重外。但如果格式错误，系统可能将这些解释性文字或引用同样视为正文进行查重。

引号与引用标识： 系统虽然主要靠文字匹配，但也辅以一些基础格式标记辅助判断引用。如果你直接复制了别人的话，虽然查重算法本身能检测到相同文字（重复源），但规范的加引号（或缩进格式）再加上准确的引用标注（作者、年份），会向机器和最终阅卷者清晰地表明这是“引用内容”。格式不正确（该加引号没加、该缩进没缩进），或者引号加对了但没标注出处，这部分被检测出的重复文字会算作你抄袭。

页眉页脚忽略： 常规情况下，系统会自动排除页眉页脚（如学校名称、页码等）的内容。但如果排版错误导致本该在正文中的内容被放在了页眉页脚里，这部分内容可能被忽略不计，或者反过来，本该在页眉页脚的内容被算入正文比对。